Pracownia Zakażeń Szpitalnych zajmuje się monitorowaniem badań mikrobiologicznych pacjentów, ich kwartalna analizą oraz rejestracją drobnoustrojów alarmowych. Uczestniczy w pracach Zespołu ds. Zakażeń Szpitalnych oraz Zespołu ds. Antybiotykoterapii; pomaga klinicystom w interpretacji wyniku badania mikrobiologicznego oraz monitoruje stosowaną antybiotykoterapię. Prowadzi również szkolenia dla wszystkich grup zawodowych Szpitala w zakresie profilaktyki zakażeń, antybiotykoterapii oraz wykonywania badań mikrobiologicznych.

Pracownia toksykologii wykonuje szeroki zakres analiz z zakresu substancji toksycznych oraz monitorowanej terapii lekowej na potrzeby Szpitala, Wojskowej Komisji Lekarskiej i podmiotów zewnętrznych.