Pracownia Zakażeń Szpitalnych zajmuje się monitorowaniem badań mikrobiologicznych pacjentów, ich analizą oraz rejestracją drobnoustrojów alarmowych. Uczestniczy w pracach Zespołu ds. Zakażeń Szpitalnych oraz Zespołu ds. Antybiotykoterapii; pomaga klinicystom w interpretacji wyniku badania mikrobiologicznego, wyborze antybiotyku oraz monitoruje stosowane leczenie przeciwdrobnoustrojowe. Prowadzi również szkolenia dla wszystkich grup zawodowych Szpitala w zakresie profilaktyki zakażeń, antybiotykoterapii oraz wykonywania badań mikrobiologicznych. Uczestniczy w europejskich programach monitorowania zakażeń, stosowanej antybiotykoterapii, lekooporności drobnoustrojów